クラミジア治療薬は基本的に抗生物質で、マクロライド系・テトラサイクリン系・ニューキノロン系の3種類があります。いずれの種類もクラミジア細菌に対する有効性が認められていますが、最も推奨されているのはマクロライド系です。マクロライド系の中でも特に、アジスロマイシン（商品名ジスロマック）が推奨されます。
アジスロマイシンは現存するクラミジア治療薬の中で持続性が最も高く、有効成分1,000gとした1回服用で7日?10日間程効果が持続します。1回の服用でクラミジアを治癒できる薬は現状アジスロマイシンだけのため、近年における最もメジャーなクラミジア治療薬となっています。
アジスロマイシン開発以前の主力は、同じマクロライド系の抗生物質クラリスマイシンでした。クラリスマイシンは1回の有効成分を200mgとして1日2回の服用を7日間継続することで効果を発揮するため、服用の仕方に関してアジスロマイシンよりも手間がかかります。そのことから、クラリスマイシンよりもアジスロマイシンの方が推奨される治療薬となりました。
また、アジスロマイシンは胎児への毒性が低いと言われています。妊娠中にクラミジア治療薬を使うことは避けられてきましたが、アジスロマイシンは胎児への毒性の低さが認められているため、唯一妊娠中のクラミジア治療に使える薬となっています。ただし、治療には医師の判断が必須です。
男性の性器クラミジアによる尿道炎に対してはテトラサイクリン系の抗生物質ビブラマイシン、女性の性器クラミジアにはニューキノロン系の抗生物質レボフロキサシンが推奨されます。ビブラマイシンは1回の有効成分100mgとして1日2回を7日間継続投与、レボフロキサシンは1回あたりの有効成分500mgとして1日2回を7日間継続投与します。
アジスロマイシンがクラミジア治療薬としては最も推奨されますが、場合によってはテトラサイクリン系のビブラマイシンやニューキノロン系のレボフロキサシンが強く推奨されることもあります。しかし、テトラサイクリン系とニューキノロン系は胎児への毒性が確認されています。したがって、妊娠中のクラミジア治療薬として使えるのかがマクロライド系アジスロマイシンと他2種類の大きな違いになります。
クラミジアの治療期間は、治療薬の服用開始日から約1ヶ月が目安です。服用開始日から7日?10日間は薬剤の効果が持続する期間、それから投薬後の検査を行うまでに2週間?3週間の期間があり、総じて約1ヶ月の治療期間となります。また、病理検査の結果が出るまでには3日程かかります。
